Ο Χρήστος Γιαννακάκης είναι Αντιπρόεδρος της Εθνικής Ενωσης Αγροτικών Συνεταιρισμών - ΕΘΕΑΣ. Παράλληλα κατέχει τη θέση του Προέδρου της Εταιρείας "Συνεταιριστικές Ελληνικές Εξαγωγές Α.Ε." και Αντιπροέδρου της Συνεταιριστικής Κονσερβοποιίας :Venus Growers".